生化-核苷酸降解和代谢
第一节 分解代谢
一、核酸的降解
核酸由磷酸二酯酶水解,有核糖核酸酶、脱氧核糖核酸酶、内切酶和外切酶之分。蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸二酯酶都是外切酶,既可水解dna,又可水解rna,但蛇毒磷酸二酯酶从3’端水解,生成5’-核苷酸;牛脾磷酸二酯酶从5’端水解,生成3’-核苷酸。细胞内还有限制性内切酶,可水解外源dna。
二、核苷酸的降解
核苷酸由磷酸单酯酶水解成核苷和磷酸,特异性强的酶只水解5’-核苷酸,称为5’-核苷酸酶,或相反。核苷磷酸化酶将核苷分解为碱基和戊糖-1-磷酸,核苷水解酶生成碱基和戊糖。核糖-1-磷酸可被磷酸核糖变位酶催化为核糖-5-磷酸,进入戊糖支路或合成prpp。
三、嘌呤的分解
(一)水解脱氨:腺嘌呤生成次黄嘌呤,鸟嘌呤生成黄嘌呤。也可在核苷或核苷酸水平上脱氨。
(二)氧化:次黄嘌呤生成黄嘌呤,再氧化生成尿酸。都由黄嘌呤氧化酶催化,生成过氧化氢。别嘌呤醇是自杀底物,其氧化产物与酶活性中心的mo4+紧密结合,有强烈抑制作用。可防止尿酸钠沉积,用于治疗痛风。
(三)鸟类可将其他含氮物质转化为尿酸,而某些生物可将尿酸继续氧化分解为氨和co2。
四、嘧啶的分解
胞嘧啶先脱氨生成尿嘧啶,再还原成二氢尿嘧啶,然后开环,水解生成β-丙氨酸,可转氨参加有机酸代谢。胸腺嘧啶与尿嘧啶相似,还原、开环、水解生成β-氨基异丁酸,可直接从尿排出,也可转氨生成甲基丙二酸半醛,最后生成琥珀酰辅酶a,进入三羧酸循环。
第二节 合成代谢
一、嘌呤核糖核苷酸的合成
(一)从头合成途径
1嘌呤环的元素来源
2imp的合成:其磷酸核糖部分由prpp提供,由5-磷酸核糖与atp在磷酸核糖焦磷酸激酶催化下生成。imp的合成有10步,分两个阶段,先生成咪唑环,再生成次黄嘌呤。首先由谷氨酰胺的氨基取代焦磷酸,再连接甘氨酸、甲川基,甘氨酸的羰基生成氨基后环化,生成5-氨基咪唑核苷酸。然后羧化,得到天冬氨酸的氨基,甲酰化,最后脱水闭环,生成imp。
3amp的合成:imp与天冬氨酸生成腺苷酸琥珀酸,由腺苷酸琥珀酸合成酶催化,gtp提供能量。腺苷酸琥珀酸裂解酶催化分解生成amp和延胡索酸。
4gmp的合成:imp先由次黄嘌呤核苷酸脱氢酶氧化生成黄嘌呤,再由谷氨酰胺提供氨基,生成gmp。
(二)补救途径:
1碱基与核糖-1-磷酸在特异的核苷磷酸化酶催化下生成核苷,再由其核苷磷酸激酶生成核苷酸。只有腺苷激酶。
2嘌呤与prpp在磷酸核糖转移酶催化下生成核苷酸。有腺嘌呤磷酸核糖转移酶和次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶。
(三)调控
从头合成途径受amp和gmp的反馈抑制,第一步转酰胺酶受二者抑制,分枝后的第一步只受自身抑制。从头合成与补救途径之间有平衡。先天缺乏次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶称为莱-纳二氏综合症,x染色体隐性遗传,患者尿酸和prpp水平高,从头合成加速,导致痛风和自残。正常大脑中次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶活力高,而从头合成酶活力低,对补救途径依赖较大。别嘌呤醇可降低尿酸浓度,但不能降低prpp浓度,不能防止自残。
二、嘧啶核糖核苷酸的合成
(一)尿嘧啶核苷酸的合成:谷氨酰胺与碳酸氢根在氨甲酰磷酸合成酶催化下生成氨甲酰磷酸,消耗2个atp。氨甲酰磷酸与天冬氨酸生成氨甲酰天冬氨酸,闭环氧化生成乳清酸,再与prpp生成乳清苷酸,脱羧生成ump。
(二)cmp的合成:ump先与2分子atp反应生成utp,在ctp合成酶催化下与谷氨酰胺、atp生成ctp。
(三)补救途径:尿嘧啶可与prpp生成ump,也可与1-磷酸核糖生成尿苷,再被尿苷激酶催化生成ump。胞嘧啶不能与prpp反应,但胞苷可被尿苷激酶催化生成cmp。
(四)调控:氨甲酰磷酸合成酶受ump反馈抑制,天冬氨酸转氨甲酰酶和ctp合成酶受ctp反馈抑制。
三、脱氧核糖核苷酸的合成
(一)核糖核苷酸的还原:由核糖核苷酸还原酶体系催化,包括4种蛋白,可将ndp还原为dndp,需镁和atp。各种核苷一磷酸酸可被特异的核苷一磷酸激酶催化生成核苷二磷酸,核苷二磷酸激酶特异性很低,可催化核苷二磷酸和核苷三磷酸的相互转变。
(二)碱基和脱氧核糖-1-磷酸可由磷酸化酶合成脱氧核糖核苷,再由脱氧核糖核苷激酶生成脱氧核糖核苷酸。
胸腺嘧啶核苷酸的生成:dump被甲叉四氢叶酸甲基化,生成dtmp,由胸腺嘧啶核苷酸合成酶催化。转甲基后生成二氢叶酸,由二氢叶酸还原酶再生。叶酸类似物如氨基蝶呤、氨甲蝶呤等,能与二氢叶酸还原酶不可逆结合,抑制一碳单位的转移反应,可作抗肿瘤药物。dump可由udp还原、脱磷酸生成,也可由dcmp脱氨生成。
第三节 辅酶核苷酸的合成
一、nad的合成
烟酸先与磷酸核糖焦磷酸生成烟酸单核苷酸,再与atp缩合生成烟酸腺嘌呤二核苷酸,最后由谷氨酰胺酰胺化生成nad。nad激酶催化生成nadp。
二、fad的合成
黄素先与atp生成黄素单核苷酸,再与atp生成fad。
三、辅酶a的合成
泛酸先与atp生成4-磷酸泛酸,再与半胱氨酸缩合并脱羧生成4-磷酸泛酰巯基乙胺,与atp缩合成脱磷酸辅酶a,最后被atp磷酸化成辅酶a。