金石部
金箔
辛平。鎮邪祟，安魂魄，制癲癇。生金有毒能殺人。用箔不得過二分。仲景紫雪方用赤金煎液，取其制肝風，降炎逆也。輕粉，水銀所傷，非金莫療。
銀箔
性味主治皆同金箔，但金有毒，而銀無毒耳。
自然銅
辛平。消瘀血，續筋骨，止痛排膿。不可多服。
銅青
酸。走厥陰，故能退利風痰，眼障、蟲疳皆治。
鉛
甘寒。屬水入腎。秉北方癸氣，陰極之精，其體重實，其性濡滑。故黑錫丹得汞交感，治上盛下虛，氣升不降，發為眩暈、噎膈反胃，鎮墜之性，有反正之功。但偏於陰降，不可多服。燒酒、醋釀成鉛水，為降火神丹。然亦禁多用。
黃丹
體重，性沉，味兼咸。能墜痰去怯，治驚癇顛狂吐逆；能消積殺蟲，治疳疾瘧痢；能解熱拔毒，長肉去腐，治惡瘡腫毒。
鐵落
制肝下降。主善怒發狂、顛癇驚邪客忤。
紫石英
甘溫，手少陰、足厥陰血分藥也。上能鎮心，重可去怯也；下能益肝，濕可去枯也。心主血，肝藏血，性暖而補，故神不安，血不足，虛寒不孕者宜之。
硃砂
甘微寒，心經藥也。養精神，安魂魄，辟邪魅，治癲癇，解諸毒，祛鬼瘧。硃砂稟離火之氣，性反涼者，高中有陰也。納浮游之火，安君主之官，秉陽明之德，闢幽昧之邪，藥中神聖也。形如箭鏇，透明者佳。研細，水飛三次用。
水銀
辛寒，有毒。鎮墜痰氣上逆，嘔吐反胃；殺蟲墮胎，下死胎。水銀乃至陰之精，稟沉著之性。得凡火煅煉，則飛騰靈變；得人氣熏蒸，則入骨鑽筋。近巔頂，則蝕腦而百節攣廢；近陰莖，則陰消而痿敗不興。同黑鉛結砂，則鎮墜痰涎：同硫黃結砂，則極救危病，在用之者合宜爾。
輕粉
辛溫，有毒。治痰涎、積滯、鼓脹、毒瘡，殺蟲搜風。按：輕粉乃咸礬煉水銀而成，其氣燥烈，其性走竄，善劫痰涎。消積滯。故水腫、風痰、濕熱、楊梅毒瘡服之，則涎從齒齦而出，邪郁暫開而愈。若服之過劑及用之失宜，則毒氣被逼，竄入經絡筋骨，莫之能出。變為筋攣骨痛，發為癰腫疳漏，經年累月，遂成廢痼，因而夭枉者不少也。
銀硃
辛溫，有毒。劫痰破積殺蟲，其功與輕粉同，其為害亦同也。廚人染食供饌，未知其害耳。
雄黃
辛溫，有毒，肝家藥也。拽肝氣，瀉肝風，消涎積，解百毒，闢百邪，殺百蟲，截鬼瘧，理蛇傷，能化血為水。
石膏
甘寒，足陽明藥也。除胃熱，止陽明頭額痛，日晡寒熱，大渴引飲，中暑，潮熱胃火，牙疼，皮熱如火。元素曰：能寒胃，令人不食，非腹有極熱者，不宜輕用。東垣云：邪在陽明，肺受火邪，故用以清肺，所以有白虎之名。孫兆曰：四月以後天氣熱時，宜用白虎。壯盛人生用，虛人糖拌炒。恐妨脾胃。火煨亦可。
滑石
甘寒。利竅除熱，清三焦，涼六腑，化暑氣，通水腫，退黃疸，止諸血，解煩渴，厚腸胃。時珍曰：滑石利竅，不獨小便也。上利毛腠之竅，下利精溺之竅。通上下，徹表裡，故主治甚多。小便利及精滑者禁用。
赤石脂
甘酸辛溫。補心血，生肌肉，厚腸胃，除水濕，收脫肛。好古曰：澀可去脫，石脂為收斂之劑，赤者入丙丁，白者人庚辛。瀉痢初起者，勿用。火煅。
爐甘石
陽明藥也。受金銀之氣所生，故能平肝。治目清腫，退赤去爛除翳。火煅紅。童便淬七次，研粉，水飛。入硃砂則不黏膩。
海石
乃水沫結成，色白體輕，肺之象也。氣味鹹寒，潤下之用也。故入肺除痰嗽而軟堅，上源既清，故又治諸淋。肝屬木，當浮而反沉，肺屬金，當沉而反浮，何也？肝實而肺虛也。故石入水則沉，而南海有浮水之石；木入水則浮，而南海有沉水之香木。
陽起石
鹹溫。主下部虛寒，助陽種子。火煅，水飛。
磁石
色黑，入腎，益精明目，聰耳鎮驚。
代赭石
止反胃，吐血衄血，月水不止，腸風瀉痢，脫精遺溺，小兒驚疳，女人崩漏。按：代赭入肝與心胞，專主二經血分之病。仲景治汗吐下後心下硬，噫氣，用旋覆代赭湯，取其重以鎮虛逆，赤以養陰血也。煅紅、醋淬搗，水飛。
砒石
辛酸大熱，大毒。主老瘧，齁喘，癖積，蝕瘀腐，瘰癧。砒本大熱大毒，煉之成霜。其毒尤烈，人服至七八分必死，得酒頃刻立斃，雖綠豆冷水立難解矣。入丸藥中，劫哮喘痰瘧，誠有立地奇功。須冷水吞之，不可飲食，安臥一日，即不作吐；少物引發，即作吐也。惟宜生用，不可經火。
青礞石
鹹平。破老痰堅積，止咳嗽喘急。色青乃厥陰之藥，肝木乘脾，土氣不運，痰滯胸膈，宜其重墜，令木平氣下，則痰症自愈。脾虛家不宜多服。入罐打碎，礞石四兩拌勻消石四兩，同煅至消盡，礞石色如金為度。研細，水飛用。
花蕊石
石主金瘡出血，一切失血，女人血暈，且化血為水，故雖有殊功，不敢多用。煅研，水飛。
石燕
利竅，行濕通淋，目障腸風，痔瘻帶下，磨汁飲之。難產者，兩手各握一枚，即生。
朴硝
苦辛寒。一經煮煉即為芒硝。鼎罐升煅，即為玄明粉。主五臟積聚，久熱胃閉，痰實血結，明目下胎。《內經》云：熱淫於內，治以鹹寒。故承氣湯，用以軟堅去實。朴硝重濁，止堪塗傅。芒硝輕爽，可供走血蕩腸之需。玄明更佳，然止於治病。服食則不可耳。
硫黃
咸熱，有毒。主命門火衰，陽氣暴絕，陰症傷寒，陽道痿弱，老人虛秘，婦人血結，虛人寒利，心腹積聚。按：硫秉純陽之精，益命門之火，熱而不燥，能潤腸結，亦救危神劑。故養正丹用之，常收起死之功。能化鉛為水，修煉家尊為金液丹。寇宗奭云：下元虛冷，真氣將絕，久患泄瀉，垂命欲盡，服無不效，但中病當便已，不可盡劑。番舶者良，取色鮮潔者，以萊菔剜空，入硫在內，合好，糠火煨熟，去其臭氣；再以紫背浮萍同煮，消其火毒；又以皂莢湯，淘去黑漿。一法：絹袋盛鹼水煮三日夜，取出清水漂淨用。畏細辛、醋、諸血。土硫，止可入瘡科，不堪服餌。壬子秋，余應試北雍，值孝廉張抱赤，久荒於色，腹滿如斗。參湯送金匱丸，小便稍利，滿亦差減。越旬日而滿如故，肢體厥逆，仍投前丸，竟無裨也。舉家哀亂，惟治終事。抱赤泣而告曰：若可救我，當終其身父事之。余曰：即不敢保萬全，然餌金液丹至數十粒，尚有生理。抱赤連眼百粒，小便遄行，滿消食進，更以補中、八味並進，遂獲痊安。故夫藥中肯綮，如鼓應桴。世之病是症，而不得援者眾矣。有如抱赤之傾信者，幾何人哉，況硫非治滿之劑，只因元陽將絕，而參附無功，藉其純陽之精，令陰寒之滯見暖冰消爾。
膽礬
酸澀辛寒。性斂而能上升，湧吐風熱痰涎。治喉痹崩淋，能殺蟲，治陰燭。產銅坑中，磨鐵如銅者真。
白礬
酸澀性涼。主消痰燥濕，解毒止血，定痛止痢，除咽喉口齒諸病，虎、犬、蛇、蠍百蟲傷。主治與膽礬同，收而燥濕，痰飲瀉痢，崩帶，風眼，皆用也。性能卻水，多服損肺。
無名異
甘平鹹寒。治金瘡，療折傷，收濕氣，生肌肉。按：無名異，陽石也，善理折傷內損，止毒止痛，故臨杖人用以溫服三錢，則不甚傷。亦善收水氣，故煎煉桐油者，不可缺也。
硼砂
甘涼微咸。退障除昏，開努肉；消瘕通膈，殺勞蟲，生津止嗽，治喉痹，口齒諸病。按：硼砂之性能柔五金而去垢膩，故治膈積塊，痰核努肉，目翳骨哽等症，但可療有餘，難施於不足，虛勞症中非所宜也。有二種，出西番者白如明礬，南番者黃如桃膠。能制永啞銅。